天皇杯全日本サッカー選手権大会の３回戦の11試合が10月14日、各地で開催された。
 
　３日前にMIOびわこ滋賀との再試合を制して勝ち上がった横浜は、J２の大分と対戦。２回戦に続き延長戦に突入する苦しい展開となったが、延長前半の99分に伊藤が決勝点を決め、４回戦にコマを進めた。
 
　快進撃を続けるJ３の町田は、J２で３位の福岡と対戦。この日もここまでの勢いは止まらず、50分にDFのペ・デウォンのゴールで先制すると、65分には久木野の追加点で２-０と快勝した。同じく２回戦で清水を破って勝ち上がったJ３の藤枝は、この３回戦でもJ１の山形と対戦。23分に大石のゴールで先制したものの、後半に逆転を許し、J１連破はならなかった。
 
　カシマスタジアムで行なわれた茨城ダービーの鹿島対水戸の一戦は、ともに譲らぬ熱戦となりPK戦に突入。これを３-２で制した水戸が４回戦進出を決めた。鹿島は昨年の初戦敗退に続く早期敗退となってしまった。
 
　その他、川崎は大久保の先制点をはじめ３点を奪って京都に快勝。神戸は渡邉のゴールで千葉の挑戦を退けた。仙台と大宮の対戦は、PK戦を４-３で制した仙台が４回戦に駒を進めた。一方新潟はJ２の徳島を相手に先制を許し、いったんはレオ・シルバの同点弾で追いついたものの、その３分後に長谷川に勝ち越し点を許し万事休す。徳島が新潟に競り勝った。
 
　４回戦の組み合わせ抽選会は10月22日に開催。10月10日に湘南を破った松本を含む、３回戦を勝ち抜いた12チームに、G大阪、柏、浦和、FC東京の４チームを加えた16チームの激突が始まる。
 
　天皇杯３回戦の結果は以下のとおり。
 
天皇杯３回戦
 
横浜 １-０ 大分
水戸 ０（３PK２）０ 鹿島
甲府 １-０ 愛媛
鳥栖 ０（２PK１）０ 札幌
徳島 ２-１ 新潟
山形 ２-１ 藤枝
広島 １-０ 熊本
町田 ２-０ 福岡
仙台 ０（４PK３）０大宮
川崎 ３-０ 京都
神戸 １-０ 千葉