天皇杯は、９月７日、10日に４回戦が行なわれ、ベスト８が出揃った。７チームが残っていたJ２勢は、千葉、山形、北九州の３チームが準々決勝へ勝ち上がった。
 
　現在J１リーグで２位の鳥栖は山形と対戦。スコアレスで迎えた107分、山形のFW萬代の突破を許し、決勝点を奪われた。勝った山形は、2010年度以来の８強進出を決めた。さらにJ１勢では、甲府が０-０からのPK戦の末に、北九州に敗れている。
 
　唯一J２同士の対戦となった千葉対長崎は、千葉が10分に先制点を奪われながらも46分に町田のゴールで追いつき、延長後半の110分に井出からのラストパスをケンペスが流し込み、これが決勝点に。千葉が粘り強く逆転勝ちを収めた。
 
その他、C大阪が磐田に２-０、大宮が愛媛に２-１、名古屋が群馬に１-０と、それぞれJ１勢がJ２を相手に貫録勝ち。J１勢同士の対戦では、G大阪が佐藤晃大の２得点などで広島に３-１で勝利、清水はイ・キジェの決勝点で２-１でFC東京を下した。
 
　準々決勝の組み合わせは抽選によって決まり、10月11日（土）、12日（日）に行なわれる。
 
天皇杯／４回戦の結果
清水 ２-１ FC東京
G大阪 ３-１ 広島
C大阪 ２-０ 磐田
山形 １-０ 鳥栖
北九州 ０（４PK３）０ 甲府
千葉 ２-１ 長崎
大宮 ２-１ 愛媛
名古屋 １-０ 群馬


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