バルサの歴史に残る黄金時代を創成したジョゼップ・グアルディオラが監督の座を退き、彼の下でアシスタントコーチを務めたティト・ビラノバが昇格。新たな時代に向かって歩み始めたチームの舵取りを任されることとなった。
 
　即戦力の補強は新指揮官が要求した左SB（ジョルディ・アルバ）、CBとMFをこなせるマルチロール（アレックス・ソング）に止まり、前任者が創り上げたポゼッション重視の攻撃サッカーを引き継ぎ、さらなる進化を狙った。
 
　そして始まったリーガでは、開幕６連勝という好スタートを切る。６節のセビージャ戦では敵地で２点をリードされながらアディショナルタイムで逆転勝利を挙げるなど、さらなる勢いを得て、首位を快走した。
 
　７節のクラシコを２-２で引き分けた後、そこから再び連勝街道を走り、数字を12まで伸ばしたバルサ。そのなかで驚異的なゴールラッシュを見せたのがリオネル・メッシだ。前半戦を終える時点で、すでに28ゴールを挙げていた。
 
　前シーズンに50得点という大記録を成し遂げ、さらに2012年の年間得点数91がゲルト・ミュラーの記録（85）を40年ぶりに更新したメッシは、この年で４年連続のバロンドール受賞（これも新記録）を果たすなど、もはや完全に別次元の存在だった。
 
　このシーズン、11節から出場した21試合全てでゴールを決めるというリーガ新記録を達成。そして最終得点数は46で（怪我がなければ２年連続の50超えは可能だっただろう）、２シーズン連続で得点王に輝くこととなる。
 
　当然、バルサでも彼はアンタッチャブルな存在であり、ビラノバ体制でもメッシを活かすためのサッカーが展開されることになったが、そこから前体制でもそうだったように、徐々にメッシ依存の様相を強くしていく。彼が欠場すれば一気にチーム力は低下。セスク・ファブレガスの"偽９番"では、相手に脅威を与えることはできなかった。
 
　またビラノバ監督は、ダビド・ビジャが欠場中はアンドレス・イニエスタ、セスク、シャビ、セルヒオ・ブスケッツの４人を同時にピッチに並べることが多かったが、バルサは前線からの守備が弱まり、徐々に最終ラインに負担がかかるようになる。後半戦になると、守備陣は疲弊し、相手に完全フリーでのシュートを許す場面も増えていった。
 
　カンテラ出身選手が思ったほど成長せず、選手層に厚みを加えられないなど、問題も多く噴出したバルサだが、それでもリーガでは２位の宿敵レアル・マドリーに勝点15もの差をつけて２シーズンぶりの栄冠を手にした。
 
　一方、チャンピオンズ・リーグ、国王杯ではともに準決勝で力尽き、とりわけ前者はバイエルンに２試合合計０-７で敗れ去るなど、ここからも後半戦での息切れ感が窺えた。
 
　就任１年目で何とかリーガというタイトルの奪還に成功したビラノバ監督だが、11年にも手術した唾液腺に再び悪性腫瘍がシーズン中に見つかり、放射線治療のためにリーガ17節、21～29節で指揮をアシスタントのジョルディ・ロウラに任せることを余儀なくされた。
 
　このことも、チームマネジメントがうまく機能しなかったという意味で、バルサが苦労する要因のひとつとなった。
 
　治療を終えてベンチに戻って来たビラノバは、翌シーズンのチームの指揮にも意欲を見せ、上層部も続投を明言していたが、病魔がそれを邪魔することとなる……。

◎2012-13シーズン成績
リーガ：優勝（32勝４分け２敗・115得点40失点）
国王杯：準決勝敗退（対レアル・マドリー）
チャンピオンズ・リーグ：準決勝敗退（対バイエルン）
 
チーム内得点ランキング（リーガ）：メッシ（46点）、セスク（11点）、ビジャ（10点）、A・サンチェス（８点）、ペドロ（７点）、テージョ（７点）、シャビ（５点）、アドリアーノ（５点）、イニエスタ（３点）、チアゴ（２点）、ピケ（２点）、ジョルディ（２点）、ブスケッツ（１点）、ソング（１点）、プジョール（１点）、モントーヤ（１点）
 
◎主なトランスファー
◇IN
夏
DF ジョルディ（←バレンシア）
MF ソング（←アーセナル）
◇OUT
夏
MF ケイタ（→大連）
MF アフェライ（→シャルケ）
冬
FW クエンカ（→アヤックス）