第96回天皇杯全日本サッカー選手権大会は９月22日、３回戦が各地で行なわれた。

　唯一の企業チームとして残っていたJFLのHonda FC（静岡県代表）はJ３の盛岡（岩手県代表）と対戦。26分に大町のゴールで先制したHonda FCは、いったんは追いつかれたものの後半アディショナルタイムの中川のゴールで２-１と劇的な勝利を飾った。

　激戦となったのは神戸対山形の一戦だ。前半にP・ジュニオールの２得点でリードした神戸だったが、後半に入り山形が猛反撃。ディエゴ、松岡のゴールで追いつくと、80分には大黒が勝ち越しゴールを奪う。しかし粘る神戸も後半アディショナルタイムに高橋祥が同点ゴールを決め、試合は延長戦へ。延長でも決着がつかず、PK戦に突入すると、これを５-３で制した神戸が４回戦進出を決めた。

　また、横浜対東京Vは４-０で横浜が格の違いを見せつけた。この試合で復帰を果たした中村俊輔は、18分に先制点を挙げ、勝利に大きく貢献している。

　その他、鹿島、新潟、清水、大宮が勝ち名乗りを挙げている。

　３回戦（18時現在）の試合結果は下記の通り。なお４回戦の組み合わせは、３回戦終了後に発表される。

Honda FC ２-１ 盛岡（ユアスタ）
新潟　１-０　山口（デンカS）
清水　１-０　大分（中銀スタ）
鹿島　２-１　岡山（カシマ）
神戸　３（５PK３）３　山形（神戸ユ）
大宮　５-０　磐田（NACK）
横浜　４-０　東京V（春野陸上）
川崎×千葉（18時／等々力）
湘南×徳島（19時／BMWス）
長野×横浜FC（19時／パロ瑞穂）
柏×愛媛（19時／柏）
鳥栖×C大阪（19時／ベアスタ）