第96回天皇杯が８月27日に開幕。同27日、28日に１回戦が開催された。J１の磐田、福岡はいずれも初戦を突破した。J２勢では町田、岐阜が敗れる波乱があった。

　また、３回戦までは組み合わせが決まっており、ラウンド16以降の組み合わせは３回戦終了後に発表される。なお、決勝は2017年１月１日（日・祝）に市立吹田サッカースタジアムで行なわれる。
 
　天皇杯１回戦の結果は、下記のとおり。
 
８月27日（土）
18:00　ガイナーレ鳥取 ５-０ ファジアーノ岡山ネクスト　とりスタ
18:00　FC町田ゼルビア ０-１ 神奈川大　町田
17:00　栃木ウーヴァFC １（３PK４）１ 山梨学院大オリオンズ　栃木グ
18:00　徳島ヴォルティス ６-０ FC徳島セレステ　鳴門大塚
17:00　ギラヴァンツ北九州 １-０ 福岡大　本城
17:00　AC長野パルセイロ ５-０ 北陸大　南長野
18:30　V・ファーレン長崎 ２-１ 高知ユナイテッドSC　トラスタ
18:00　大分トリニータ ３-０ MD長崎　大銀ド
19:00　清水エスパルス ２-１ 関西大　アイスタ
18:00　水戸ホーリーホック １-０ 東京国際大　Ksスタ
17:00　カターレ富山 １-０ 新潟医療福祉大　富山
13:00　北海道コンサドーレ札幌 ３-０ 筑波大　札幌厚別
15:00　松江シティFC １-４ ファジアーノ岡山　松江陸
16:00　東海学園大 １-２ 鈴鹿アンリミテッFC　名古屋港
18:00　モンテディオ山形 ２-１ アルテリーヴォ和歌山　NDスタ
15:00　ザスパクサツ群馬 １-０ ソニー仙台FC　群馬サ
13:00　MIOびわこ滋賀 １-３ 関西学院大　東近江
18:00　レノファ山口 ４-０ 東海大熊本　維新公園
15:00　福島ユナイテッドFC ４-１ ザスパ草津チャレンジャーズ　とうスタ
18:00　東京ヴェルディ １-０ VONDS市原FC　味フィ西
13:00　奈良クラブ ２-０　京都産業大　鴻ノ池
16:00　SRC広島 ０-４ 愛媛FC　広島一球
13:00　FC岐阜 １-２ Honda FC　長良川球
13:00　ブラウブリッツ秋田 ２-０ ヴァンラーレ八戸　A-スタ
18:00　ジェフユナイテッド千葉 ５-０ 北海道教育大岩見沢校　フクアリ
19:30　FC琉球 ０-３ ホンダロックSC　沖縄県陸

８月28日（日）
18:00　ジュビロ磐田 ７-０ FC岐阜SECOND　ヤマハ
18:00　横浜FC ５-０ 山形大　ニッパツ
16:00　アビスパ福岡 ７-２ 鹿児島ユナイテッドFC　レベスタ
19:00　ロアッソ熊本 ２-１ FC.TOSU　うまスタ
16:00　カマタマーレ讃岐 ２-１ FC今治　ピカスタ
13:00　グルージャ盛岡 ４-０ 早稲田大　岩手陸
18:00　松本山雅FC ６-０ 徳山大　松本
16:00　ツエーゲン金沢 ４-１ サウルコス福井　石川西部
19:00　セレッソ大阪 10-０ アルヴェリオ高松　金鳥スタ
18:00　京都サンガFC ４-０ バンディオンセ加古川　西京極